:yasuhiro様の質問の便乗のような形になってしまいますが、自分も前半行程のルート１が設定されている後に
後半のルートの追加を行うと元のルート１がルート２になり、追加したルートがルート１に設定されて標高グラフがおかしくなります。
時間も入力しているのに、なぜルート1が後になるのかも謎ですがこれを治す方法は現段階で無いのでしょうか？
自分は手入力なのですが、長距離歩いているルートだと、だんだん記入の動きが鈍くなるので分割でやりたいのですが・・・。
それか手入力でも動きが鈍くならない方法など有れば是非お聞きしたいのですが・・・。

peco1978さん回答ありがとうございます。
さっそく逆の順番で記入しレコを書き終わりました。ありがとうございました。