私もそれで悩みました。
一部手打ちにするなど分割してアップしたいときは、逆順にルートを追加しています。

確かにGPSログが３分割されていますね、

ログを一度削除して順番通りにもう一度ログをアップし直されたらどうでしょう、

フリーソフトカシミールを使えばログを接続し直して再度アップし直してはどうでしょう

カシミールを起動、ログを読み込み、
GPSデータ編集、トラックをクリック、トラック名をクリックして順番通りに並んでいるのを確認後、右クリックで３つのログを選択し、トラックを接続します。
接続したログを、ファイルの書き出しで書き出して、再度ヤマレコにアップします。