＞はどこを読み取れば良いのでしょう？
赤の線が「糸が絡まったみたい」になってる箇所がいくつかございますでしょ？
まさか、その赤線の通りに歩いてないだろうってゆうのがtatucaさんとか私の推測なんですけど、「ブレイクダンスを踊りながら遡行しとったから、実際には もっとグチャグチャやで〜」ってんなら、忘れて下さい。

＞今度、コースタイムの確実な一般道を歩いて、最適なログ取間隔を検証してみます。
はい、実は、私も それをやってみようかなと思ってました。
ただ、一般道よりは、山道のほうがベターかなと思ってまして、
どこかの「xx km」って表示が出てる登山道かハイキングコースでヤってみようかなと思ってます。
スマホのGPSは一般的に高い建物が少ない市街地（基地局がたくさんあるとこ）のほうが、山間部より精度が高くなりますので。。。

http://i.imgur.com/NvhG8Ce.jpg
↑を見てGPSの誤差が結構あることが分かってよかったです。有難うございました。

私はGPSロガーってのを使ってて、この設定で1分おき保存とか、数分おき保存とか、50mおき保存とか選べるのですが、この設定で、細か過ぎるログ取得による積算誤差を減らせるのかな…とか思いました。

こんにちは。
計画と実測の乖離が大きいのは困りますよね。
一方、GPSの機器の違いや受信の状況によっても大きな差が出ます。
Kinny2012さんの実測ログを拝見しましたが結構暴れていませんか？
自分も機器による違いを調べたことがあったので気になりました。

はじめまして。

ワタクシもこの問題に悩んだことがありますが、結論としては、実際の歩行距離は手書きでルートを結んだ山行計画に近いものであろうという結論になりました。(Kinny2012さんの例の場合には6kmに近いが、経験的にはトレイルの小さな折り返し、ピークが多いと20%程度は長いくらい。)
原因としてはGPSの測定値の細かい誤差(水平、垂直方向とも)がデータ上では移動距離に加算されていることが大きいように思えました。
ためしに今回アップロードされたGPSデータをカシミール上で拡大すると以下のように見えます。いかがでしょうか。
http://i.imgur.com/NvhG8Ce.jpg

ただし、ヤマレコで利用しているSRTM(Shuttle Radar Topography Mission)に基づく標高データは90mメッシュと聞いたような気がしますので、国土地理院の10mには現れる小ピークが滑らかになることはありえると思います。
以前、悩んだときの日記をご参考まで添付します。
http://www.yamareco.com/modules/diary/45037-detail-78969