例えば、Gmail には、受信BOX内のメールを一覧表示した時、メール一件ずつに選択用のチェックボックスがあり、一覧の上にすべてのチェックボックスをオンにするための（表示中のすべてのメール一件ずつのチェックボックスを一括でオンにするための）チェックボックスがあります。suzukitaさんの質問は、「これと同じような動作をするチェックボックスがヤマレコには無いのか？あれば一括削除が楽にできるのに。」という意味だと理解しました。

改めてヤマレコのメッセージ画面を確認しましたが、そのようなチェックボックスは無いようですね。現時点では一件ずつチェックボックスをオンにしていくしか方法が無さそうです。

では私だったらどうするか？というと、マウスではなくキーボードを使います。

初めに、メッセージ一覧画面の、一番上に表示されたメッセージ（一番新しいメッセージ）の「件名」の横当たりをマウスでクリックします。（はじめだけマウスを使います）

キーボードの [TAB] キーを押すと、クリックしたメッセージの（クリックした行の）「件名」にフォーカスが当たった状態（選択されたような状態）になると思います。さらに [TAB] キーを2回押すと、フォーカスがチェックボックスに移ります。この状態で [スペース] キーを押すとチェックボックスがオンになります。

[TAB] を3回押して [スペース] を1回押す、を繰り返せば、次々とチェックボックスをオンにしていけます。左手で [TAB] を、右手で [スペース] を押すとやりやすいと思います。慣れるとマウス操作よりずっと速くできますよ。

後はヤマレコサポート掲示板でカイゼン要望を出してみてはいかがでしょうか？
http://www.yamareco.com/modules/xsns/?cid=2

こんにちは。
スマホは知りませんがPCでは、送信メッセージ＆既読の受信メッセージは、チェックボックスにチェックを複数入れてから削除ボタンを押すことで、チェックしたメッセージを一括で削除できますよ。お試し下さい。