sabatoraさん、はじめまして。
1.ルート1を山行記録の画面からgpxファイルの形でダウンロードしてください。
2.登録しているルート1を削除してください。ルート2だけ残っている状態です。
3.ダウンロードしたgpxファイルを追加でアップロードしてください。
これでグラフ上は希望している通りにつながると思います。
ただ、時刻はずれていると思います。時刻を合わせる方法はありますが、
複雑ですので、ここでは省略します。
※私は実データと手書きを組み合わせ編集しなおして載せている山行がけっこうあります

前半のGPS実データをアップしたあと、後半のトラックを手入力したら「時刻設定」のボタンをおしてGPS実データに合わせて時間を変更すれば、正常に繋がると思います。

もし、それで駄目なら、ヤマノートに書いた「手書きGPXファイルの時間変更　＆　GPSログの欠落補完（Windows PC用）」と「GPSログ(GPXファイル)の接続および挿入（Windows PC）」のような方法でGPXファイルを接続する方法もありますので、よろしかったらご参照ください。
（これは、手書きルートをGPXデータにしてダウンロードして、その時間をGPS実データに合わせて変更して実データに接続するというものです。）