別の山行として、別々にアップすればオッ毛です。

プロフ画像から判断してスキー相当上手いですね、指導員クラスですね！

余談はさておき、本件の状況はよく分ります。
今年の４月に同件で質問があり、私も推測で回答しました。
このなかでbasemanさんの回答に詳細があります。
https://www.yamareco.com/modules/plzXoo/index.php?action=detail&qid=5715

現行システム仕様のため、歩行区間を個別に扱うか、歩行以外の距離加算を気にしないかの選択になるようです。

ただ、どうしてNGになるかOKになるかは判然としません。同じレコでも開いた時にOKだったり、NGになったりしたレコもありました。

ここから先は独り言なので、スルーして結構です（笑い）
私は今後下記のようにするつもりです。
1，メインレコとサブレコが明確な場合は同日に２レコあげる（山行回数が2になる）。年間の山行回数が多くなるが気にしない。メインレコのGPSデータを尊重し、レコを見やすくするため。
2，メインレコとサブレコが明確でない場合は1レコであげる。１日に例えば関東１００名山などの低山を４つハシゴした場合など。1レコ内に4GPSデータを追加であげる。車移動の直線距離が「ヤマレコマイレージ」に累積歩行距離として加算され、いささか不本意ですが、気にしない。
＊私がこれを多発していた時はヤマレコマイレージは無かった。
＊ここはこだわる方いると思いますよ。俺のマイレージは純粋に歩いた距離だって..。私的には、「勝手にこだわってれば」って思ってます。
3，あまりないですが、道路でチャリを使った場合、そこはGPSデータから外す。（今まではGPSデータから外しませんでした）
4，ロープウェイ利用もGPSデータから外す。

あえて悪い言い方をすれば、しょせんヤマレコが作った基準で（しかもシステム上修正できない）、ユーザーは自分の意思で変更（ステージなど表示させない等）できないので、車移動距離がステージに反映されても、【気にしない】と言うのが私のスタンスです。