両神山のログを見させて貰ましたが、谷間で大きく乱れています。谷が深いほど（空が見えないほど）GPSの電波が受信しづらくなります。
尾根道は綺麗に出ていますね。

GPSの電波を少しでも受信できるようにザックの雨蓋などに入れると良いです。

ちょっと調べてみたのですが、「旅レコプレーヤー」の「本体設定」から「記録間隔」を変更することができるようですよ。
デフォルトでは50m間隔になってるそうなので、取得できるポイント間隔を短く設定してみてはいかがでしょうか。
5秒〜10秒間隔くらいなら、徒歩でも大丈夫だと思います。
上記設定を行った上で、山行によってログが暴れるような(補足状態が悪い)場合は、ヤマレコにアップロードする際に(ヤマレコの設定で)「間引く」といいかもしれません。

HOLUX m241cに旅レコのファームウェアをいれて使ってます。
３０秒間隔ででログをとってます。
電池の消耗などを考え、まあまあじゃないかと思います。
きれいなログ？
あまりきれいかどうかは気にしていません。
とにかく手動で歩いたコースをポチポチするよりまし程度にロガーを使ってます。
何万円もする高級機種を使っておられる方のログや軌跡と比べるのは無理でしょう。
安物は安物と割り切って使うのが賢い使い方だと思います。