山頂一帯は私有地のため、入山料が必要（一人１回500円：2022年10月現在）。
二本ボソ山頂から亀山峠側へ少し下ったところに有人の料金所が一か所ある。
亀山峠から倶留尊山へ向かう場合（その逆も含む）は、一本道の登山道が有料区域を通過しているため、必ず入山料が必要。
亀山峠と倶留尊山とを往復するために二本ボソを通過する場合は、往路に料金所で入山料を支払うと、復路では入山チケットの半券を提示すればそのまま通過でき、往復で500円でよい。尚、チケットには日付があるので往復とも同日中である必要がある。
料金所小屋内にトイレ、喫煙所があり、ドリンクを販売している。いずれも係員がいる時間のみ使用可。