神峰山には南峰と北峰の二つのピークがあり、それらを総称して神峰山と呼ばれている。
標高では南峰(598m)の方が高いが、国土地理院地形図では、標高が低いが四等三角点が設置されている北峰(586.7m)を神峰山としている。
そのため、主な登山ガイド本(「分県登山ガイド茨城県の山」「日本百低山(2017年幻冬舎)」など)や登山サイト(「山渓オンライン」「ヤマップ」など)　では北峰を神峰山頂上として記載・登録している。
一方で、地元観光協会案内やウィキペディアでは南峰を神峰山頂上として紹介するなど、統一されていないのが現況である。