この遺跡は、天然の石灰岩洞窟（鍾乳洞）を利用して営まれた岩陰住居遺跡です。入口の高さは1.3m、幅3.5mで、70mほど奥まで入ることができます。昭和16年、17年、22年に4回の発掘調査が行われ、入口付近の堆積土から縄文時代草創期（約1万年前）の表裏押圧縄文土器や早期の押型文土器（丸い棒に刻みを入れ、土器の表面に転がして文様をつけたもの）をはじめ前期、中期頃までの土器、石鏃、骨角器、鹿、猪などの獣の骨など数多くの遺物が発見されました。また、炉跡と考えられる火をたいた跡も確認されています。
　これらの出土品は現在、豊橋市美術博物館に収蔵されています。
伝説　蛇穴には昔からいくつかの伝説が伝えられています。「蛇穴」という名前の由来は、昔、この穴に大蛇が住んでいたためと言われています。また明治時代の落盤で、奥行きが短くなってしまいましたが、もとはずいぶん長く、一説には信濃の善光寺まで続いたと言われています。この蛇穴には埋蔵金があり、それを守る武者がいたとも言われています。（豊橋市教育委員会）
上記の説明文は蛇穴入口前にある案内板から転記しました。
参考：豊橋市美術博物館ホームページhttp://www.toyohashi-bihaku.jp/?page_id=513